畢業後決定留在美國發展，林健祥透露：「我這輩子只花2星期找工作，跑7個州面試5家公司，全都錄取！」1987年他進入紐約上市、排名前500大的特殊材料研發公司（註：簽保密條款不便透露公司名）擔任專案研究經理，月薪達80萬元，可供妻小過上優渥生活。
華人在美國免不了遭受歧視，林健祥曾被麻省理工白人碩士指著鼻子嗆聲：「你英文這麼爛，薪水卻這麼高，公司憑什麼對你這麼好？」他用研究實力讓對方心服口服，主動為粗魯行為道歉。
「一般在美國公司他們都會說『I』，假設有功勞，專案領導都歸給自己，不管別人死活，但我都會講『we』，美國同事都非常喜歡我！」許多和他共事的夥伴也因此加薪升遷。短短4年，林健祥的能力備受認可，公司願付費供他念哈佛EMBA，條件是簽約成為接班人之一。