李文忠就任後，國防院在其主導下訂定了灰色作戰、防衛韌性兩大研究計畫，尋求與英國皇家聯合三軍研究所（RUSI）、美國戰略與國際研究中心（CSIS）合力研究，國內部分則訂定國防改革、國防預算兩大主題研究，他希望藉這四大研究計案奠定國防院的研究權威性、彰顯影響力。
對於李文忠的新政，政壇傳出不同看法，指李上任後首度操辦2024台北安全對話「規格」不比2023年，也有消息指出，國防院近來要跟某美國智庫合辦活動，但過程中，美方對於國防院的合作積極度頗有微詞，擔憂李文忠是否「重研究、輕交流」，削弱我二軌外交量能。
一位國安人士指出，國防院歷任執行長包括林正義、林成蔚、陳明祺都是學者出身，且有國安諮委歷練，長期跟國外智庫互動交流，李文忠的養成背景相對不同，雖然他從立委開始，就是民進黨少有的國防專業委員，後來也在退輔會歷練8年，對國防的專業度無庸置疑，但對智庫國際交流的想像與具體實現為何，可以繼續觀察。
李文忠接受本刊採訪表示，前總統蔡英文2018年成立國防院，賦予兩大任務，第一是1.5軌（半官方）、2軌（非官方）交流；第二則是研究。他認為國防院在歷任執行長的帶領下，已將交流工作做得非常好，這部分他會繼續延續，當下最要緊的工作，則是加強研究量能。
國防院1年約接待200個訪團，並與全世界重要智庫諸如美國蘭德公司（RAND）、戰略與國際研究中心（CSIS）、英國國際戰略研究所（IISS）、皇家聯合三軍研究所（RUSI）等往來，甚至合辦論壇。李文忠說，若訪團的專業有對口，當然要接待，但現行約有2、3成的訪團不該由國防院接待，不應一股腦全丟過來，「以後行程全都要經過我，各部會丟來的（訪團）我不一定肯，因為我們要專注研究。」
他強調智庫是否具影響力可從兩方面彰顯，一是全世界同行是否參考其研究論文。二是其研究成果是否對決策者產生影響。李文忠肯定國防院的研究水準，但他直言，「過去的研究方向跟方法有些問題。」針對一般民眾的軍事國防科普文章固然重要，但「那是附帶的，不能都在搞科普」。
李文忠認為，一旦國防院的研究愈來愈有權威性，對國人的說服力自然會愈高、溝通效果也會愈好，自然能彰顯社會影響力，反之，如果國防院寫的文章內容都是相關官員已知的，那就沒有人會看。
